И никакой связи.
Скипидар -- происхождение неизвестно, в большинстве языков это turpentine от
теребинта. Скипетр - из греческого (σκῆπτρον, skeptron) - жезл. Шкипер - из голландского skipper — «капитан» от англосаксонского scip, нидерл. sсhiрреr от sсhiр — «судно, корабль».